В решении Аспро: Премьер есть возможность группировать товары по разделам на странице сравнения товаров.

Страница сравнения без группировки:

Страница сравнения товаров с группировкой по разделам:

Для активации группировки включите режим правок и перейдите в параметры компонента каталога.

В разделе «Сравнение товаров» активируйте пункт «Использовать группировку на странице сравнения».

Теперь товары на странице сравнения будут группироваться по разделам каталога.