Одному каталогу соответствует один фасетный индекс. Он нужен для того, чтобы поиск по каталогу осуществлялся максимально быстро. После того, как вы внесли изменения в настройки умного фильтра, проверьте состояние фасетных индексов (особенно если заметили, что внесенные вами изменения не отобразились).

В административном разделе перейдите в Рабочий стол → Контент → Инфоблоки  Фасетные индексы

Если состояние индекса «Работает» и горит зеленый индикатор, то все в порядке. Если же индикатор красный и появилась кнопка «Создать», то нажмите «гамбургер» и выберите соответствующий пункт.

В списке «Информационный блок» выберите «Каталог товаров». В поле «Шаг» можете оставить значение по умолчанию.

Вы можете при необходимости отключить фасетный индекс, но делать это не рекомендуется.